「環境技術」2019年5号 記事情報

掲載年 2019
巻(Vol.) 48
号(No.) 5
284 - 288
記事種類 講座
記事タイトル 環境の分析技術・データ解析・モデル化講座+I.環境の分析技術 メタ16S分析による菌叢解析
著 者 藤井隆夫
第1著者ヨミ FUJII
第1著者所属 崇城大学名誉教授 
要 旨 1.は じ め に
大量の塩基配列データを扱う菌叢解析技術は,次世代シーケンサー(NGS)の進歩に依存している1).NGSの大半がDNAの読み取り長が1,000 塩基より短いにもかかわらず,1回のランで1 0 9 塩基を超える塩基配列を決定でき,低コストで短 時間の解析が可能になった.
本講座ではメタ16S rRNA遺伝子解析について,NGSにMiSeqを使い,出力データの前処理 のパイプラインとしてmothurを,その後の解析 に主にRを使う方法について説明する.
特集タイトル
特集のねらい